腳底按摩的時間、次數與頻率要視個人體質與狀況而定。一般來說，「雙腳全部按摩一遍需30～40分鐘」，若身體虛弱或病重者則建議時間應該縮短或視當時情況而定，最好減少按摩時間，或者當按摩反射區所產生的疼痛減輕時，即可停止不宜過久。

單一腳底反射區的按摩時間約3分鐘，要注意脊椎的反射區不可以按摩太久，因為脊椎的反射區位於骨縫，較容易受傷；但排泄系統則需視狀況輕重而定（嚴重者5分鐘，強化泌尿功能，加強體內毒素排出）。

逤器官有疾病的反射區，時間可延長。（須注意，腎臟功能良好的人才能在肝臟反射區按摩5分鐘以上，過久會使血流增加產生不良影響）

一般腳底按摩在一開始的幾天內若有持續進行操作者，可以明顯看到效果。按摩的最佳時間可以選擇晚餐後1至2個小時後，身體比較放鬆，效果會大大提高。若時間允許，可將按摩的時間安排在生活習慣中，區分為早上的30分鐘採用重強刺激手法，睡覺前的30分鐘採用輕舒緩手法，一天為一小時比較理想。

即使身體沒有不適的症狀也可以每天施行腳底按摩，針對腳部所有的反射區，進行約15至20分鐘的按摩。如此達到養生保健的作用。

請注意的是不要在飯後一小時內進行，容易引起腸胃不適。

按摩的次數、頻率因人而異，要照自己的體質、病情、病史等來決定。不過原則上一開始的療程先做十天左右，休息三至五天，讓身體漸漸習慣後，可改為每兩天做一次，休息一天，然後持續一個月，一旦健康狀況有改善後，天數與時間可以擴大。